TS.Nguyễn Văn Thành (Phó Viện trưởng - Ban Lãnh đạo Viện - VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ GIAO THÔNG VẬN TẢI); ThS.Nguyễn Trung Thêm (Phó Viện trưởng - Ban Lãnh đạo Viện - VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ GIAO THÔNG VẬN TẢI); TS.Đinh Văn Tiến (Phó Viện trưởng - Ban Lãnh đạo Viện - VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ GIAO THÔNG VẬN TẢI); ThS.Lê Tuấn Anh (Phó Viện trưởng - Ban Lãnh đạo Viện - VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ GIAO THÔNG VẬN TẢI); GS.TS. Phạm Hữu Phức (Viện trưởng giai đoạn 1976-1984 - Lãnh đạo Viện qua các thời kỳ); TS.Nguyễn Văn Thành (Q.Viện trưởng giai đoạn 7/2022-5/2024 - Lãnh đạo Viện qua các thời kỳ); PGS.TS. Phan Vị Thủy (Viện trưởng giai đoạn 1984-1993 - Lãnh đạo Viện qua các thời kỳ); PGS.TS. Nguyễn Văn Lạp (Viện trưởng giai đoạn 1993-1995 - Lãnh đạo Viện qua các thời kỳ); GS.TS. Nguyễn Xuân Đào (Viện trưởng giai đoạn 1995-2002 - Lãnh đạo Viện qua các thời kỳ); ThS. Đỗ Hữu Trí (Viện trưởng giai đoạn 2002-2005 - Lãnh đạo Viện qua các thời kỳ); ThS. Nguyễn Hoàng Huyến (Viện trưởng giai đoạn 2005-2007 - Lãnh đạo Viện qua các thời kỳ); PGS.TS. Đặng Gia Nải (Phó Viện trưởng phụ trách giai đoạn 2007-2008 - Lãnh đạo Viện qua các thời kỳ); PGS.TS. Doãn Minh Tâm (Viện trưởng giai đoạn 2008-2012 - Lãnh đạo Viện qua các thời kỳ); PGS.TS. Nguyễn Xuân Khang (Viện trưởng giai đoạn 2012-6/2022 - Lãnh đạo Viện qua các thời kỳ)